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中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所组建于2002年，前身为1950年成立的中央卫生研究院华东分院，隶属中国疾病预防控制中心，是中国寄生虫病预防控制工作业务指导中心。
研究所主要职责是为制定与寄生虫病和热带病预防控制相关的法律、法规、规章、政策、标准、规范及疾病防治规划等提供技术支持；承担全国寄生虫病和热带病预防控制的技术指导、疫情监测、质量评估以及相关的重大疫情、突发公共卫生事件应急处理；开展寄生虫病和热带病预防控制领域的科学研究、成果转化和技术推广；开展寄生虫病和热带病领域的国际合作与交流；承担国内外寄生虫病与热带病相关专业人员培训、研究生培养以及博士后工作站工作；开展寄生虫病和热带病的健康教育与健康促进；提供寄生虫病和热带病的咨询、检测、诊疗等技术服务；开展寄生虫病和热带病的科技资源、防控信息等管理工作。
根据2020年9月官网显示，中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所有职工188名，其中科技人员156名，科技人员中具有高级专业技术职称者56名；设12个业务科室。
2021年8月，中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所包虫病室被评选为第20届全国青年文明号。
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